Basics van Bio-informatica Training Cursus

Deze instructeur-geleide live training in Nederland (online of op locatie) is gericht op biologen die Biopython willen gebruiken.

Aan het einde van deze training zijn de deelnemers in staat om:

• Biologische concepten te integreren met informatietechnologieën om onderzoeksproblemen op te lossen.
• Informatie te winnen uit grote datasets van biologische oorsprong.
• Algoritmen te creëren voor essentiële onderzoekstaken.

Dit instructeurgeleide, live training in Nederland (online of ter plaatse) is gericht op gezondheidszorgprofessionals die tussen- tot gevorderde kennis willen verkrijgen over de verschillende genetische sequencing en testoperaties.

Na afloop van deze training zullen de deelnemers in staat zijn:

• Sleutelconcepten van genetica te leren en begrijpen.
• Inzicht te krijgen in het werking van genetische sequencing en testoperaties.

Microbial genomics en metagenomics combineren sequencingtechnologieën en computationale analyse om microbiele gemeenschappen te profileren, genomen te karakteriseren en functionele eigenschappen zoals antimicrobiële resistentie te detecteren.

Deze docentenbegeleide, live training (online of op locatie) is bedoeld voor beginnende tot gemiddelde onderzoekers en bioinformatici die hands-on analyse willen uitvoeren van microbial genomics en metagenomic sequencing data.

Aan het einde van deze training zullen de deelnemers in staat zijn om:

• Gemeenschappelijke sequencing workflows en sleutelbestandsformaten in microbial genomics beschrijven.
• Kwaliteitscontrole en voorverwerking van ruwe NGS-lezingen uitvoeren.
• Taxonomische profilering uitvoeren met behulp van markergebaseerde en k-mer benaderingen.
• Microbiele genomen en plasmiden assembleren en annoteren.
• SNPs detecteren, fylogenieën bouwen en populatiestructuur interpreteren.
• Antimicrobiële resistentiegenen voorspellen en functionele profielen samenvatten.
• Herhaalbare workflows gebruiken met Conda, Docker en notebookgebaseerde rapporten.

Formaat van de Cursus

• Lezingen die concepten en tools introduceren (20%).
• Hands-on praktische sessies met behulp van voorbeelddatasetten (60%).
• Open discussies en geleide analyses zodat deelnemers methoden kunnen toepassen op hun gegevens (20%).

Opties voor Aangepaste Cursussen

• Voor het aanvragen van een aangepaste workshop met focus op klinische, milieukundige of industriële metagenomics, neem contact met ons op om dit te regelen.

Deze instructeurgeleide live training in Nederland (online of on-site) is gericht op wetenschappers en iedereen die geïnteresseerd is in de basisprincipes van Nanowetenschap en haar toepassingen.

Bij het einde van deze training zullen de deelnemers in staat zijn:

• De wetenschappen en technologieën op nanoschaal te begrijpen.
• Onderwerpen op nanoschaal van die op microschaal te onderscheiden.
• De fundamentele theorie van elektronen- en energietransfer te kennen.

Deze instructeurgeleide live training in Nederland (online of ter plekke) is gericht op geavanceerde forensische wetenschappers, genetici en antropologen die NGS-technieken willen toepassen op forensische onderzoeken.

Na voltooiing van deze training zullen de deelnemers in staat zijn om:

• De principes van NGS en de toepassingen ervan in de forensische wetenschap te begrijpen.
• Forensische DNA-monsters te analyseren met behulp van NGS-technieken.
• NGS-gegevens te interpreteren voor menselijke identificatie en afstamming.
• NGS te gebruiken voor gedegradeerde en complexe DNA-monsters.
• Bio-informatische hulpmiddelen toe te passen voor forensische genomische analyse.
• De juridische en ethische overwegingen in de forensische genomica te begrijpen.

Dit is een praktische cursus, die laat zien waarom programmeren een krachtig hulpmiddel is in de context van het oplossen van biologische problemen. Tijdens de cursus leren de deelnemers de programmeertaal Python, een taal die algemeen wordt beschouwd als zowel krachtig als gebruiksvriendelijk. Deze cursus kan worden beschouwd als een demonstratie van hoe bio-informatica het leven van biologen verbetert.

De cursus is bedoeld en bedoeld voor mensen zonder informatica-achtergrond die willen leren programmeren.

Deze cursus is geschikt voor:

• Onderzoekers die zich bezighouden met biologische gegevens.
• Wetenschappers die willen leren hoe ze alledaagse taken kunnen automatiseren en gegevens kunnen analyseren.
• Managers die willen leren hoe programmeren workflows en het uitvoeren van projecten verbetert.

Aan het einde van de cursus zijn de deelnemers in staat om korte programma's te schrijven, waarmee ze biologische gegevens kunnen manipuleren, analyseren en ermee kunnen omgaan en de resultaten in een grafisch formaat kunnen presenteren.

Dit cursus beoogt onderzoekers een begrip te geven van de principes van statistische ontwerp en analyse en hun relevantie voor onderzoek in een breed scala aan wetenschappelijke disciplines.

Het dekt enkele kansrekening en statistische methoden, voornamelijk door middel van voorbeelden. Deze training bevat ongeveer 30% colleges, 70% begeleide quizzes en laboratoria.

In het geval van een gesloten cursus kunnen we de voorbeelden en materialen aanpassen aan een specifieke tak van wetenschap (zoals psychologische tests, openbare sector, biologie, genetica, enzovoort).

In het geval van openbare cursussen worden gemengde voorbeelden gebruikt.

Hoewel er verschillende softwarepakketten worden gebruikt tijdens deze cursus (Microsoft Excel tot SPSS, Statgraphics, enzovoort), ligt de hoofdzet op het begrip van de principes en processen die het onderzoek, redenering en conclusie begeleiden.

Deze cursus kan worden gegeven als een hybride cursus, d.w.z. met huiswerk en opdrachten.