Course Outline

Inleiding tot de programmeertaal Python

  • Waarom Python?
  • Gebruik van Python om biologische gegevens te verwerken
  • Werken met de iPython shell
  • Je eerste programma
  • Schrijven van Python scripts
  • Modules importeren

Werken met eiwit- en RNA/DNA-sequenties

  • Motieven vinden
  • Transcriptie en vertaling in silico
  • Afhandeling van sequentie-uitlijningen

Gegevens ontleden in verschillende biologische formaten

  • FASTA ontleden
  • Conversies van gegevensindelingen

Uitvoeren van biologische analyses

  • ONTPLOFFING
  • Accessing biologische webservices

Omgaan met biologische 3D-structuren met behulp van Python

Python Vergemakkelijkt statistische analyse

Gegevens visualiseren

  • Staaf- en spreidingsdiagrammen maken
  • Berekening van een oppervlakte onder curve (AUC)

Werken met .xls en .csv bestanden

  • Gegevens importeren uit en exporteren naar MS Excel / OpenOffice Calc
  • Schrijven .xls en .csv bestanden

Python gebruiken om een geautomatiseerde pijplijn voor gegevensverwerking te maken

Requirements

Biologische basiskennis over eiwit-, RNA- en DNA-sequenties.

  28 Hours
 

Related Courses

Related Categories