Bedankt voor uw aanvraag! Een van onze medewerkers neemt binnenkort contact met u op
Bedankt voor uw boeking! Een van onze medewerkers neemt binnenkort contact met u op.
Cursusaanbod
I. Inleiding en inleidende maatregelen
1. Overzicht
- R vriendelijker, R en beschikbare GUI's maken
- Rstudio
- Gerelateerde software en documentatie
- R en statistiek
- R interactief gebruiken
- Een kennismakingssessie
- Hulp bij functies en kenmerken
- R-commando's, hoofdlettergevoeligheid, enz.
- Oproepen en corrigeren van eerdere commando's
- Opdrachten uitvoeren van of uitvoer omleiden naar een bestand
- Permanente gegevens en het verwijderen van objecten
- Good programmeerpraktijk: Zelfstandige scripts, goede leesbaarheid bijv. gestructureerde scripts, documentatie, markdown
- het installeren van pakketten; CRAN en Biodirigent
2. Gegevens uitlezen
- Txt-bestanden (read.delim)
- CSV-bestanden
3. Eenvoudige manipulaties; getallen en vectoren + matrices
- Vectoren en toewijzing
- Vector rekenkunde
- Regelmatige sequenties genereren
- Logische vectoren
- Ontbrekende waarden
- Karakter vectoren
- Index vectoren; Subsets van een dataset selecteren en wijzigen
- Arrays
- Array indexering. Subsecties van een matrix
- Index matrices
- De array() functie + eenvoudige bewerkingen op arrays zoals vermenigvuldiging, transpositie
- Andere soorten objecten
4. Lijsten en dataframes
- Lijsten
- Lijsten samenstellen en wijzigen
- Lijsten samenvoegen
- Gegevensframes
- Het maken van dataframes
- Werken met dataframes
- Willekeurige lijsten bijvoegen
- Het zoekpad beheren
5. Manipulatie van gegevens
- Waarnemingen en variabelen selecteren, subsetten
- Filteren, groeperen
- Hercoderen, transformaties
- Aggregatie, combineren van datasets
- Vormen van gepartitioneerde matrices, cbind() en rbind()
- De aaneenschakelingsfunctie, (), met matrices
- Karaktermanipulatie, stringr-pakket
- Korte introductie in Grep en Regexpr
6. Meer over het uitlezen van gegevens
- XLS- en XLSX-bestanden
- Readr- en ReadXL-pakketten
- SPSS, SAS, Stata,... en andere formaten gegevens
- Gegevens exporteren naar txt, csv en andere formaten
6. Groeperen, lussen en voorwaardelijke uitvoering
- Gegroepeerde expressies
- Controle verklaringen
- Voorwaardelijke uitvoering: indien verklaringen
- Repetitieve uitvoering: voor loops, herhalen en while
- Inleiding tot Toepassen, Toepassen, Toepassen, Toepassen
7. Functies
- Functies aanmaken
- Optionele argumenten en standaardwaarden
- Variabel aantal argumenten
- Toepassingsgebied en de gevolgen ervan
8. Eenvoudige afbeeldingen in R
- Een grafiek maken
- Dichtheid percelen
- Puntdiagrammen
- Bar Percelen
- Lijn diagrammen
- Cirkeldiagrammen
- Boxplots
- Spreidingsdiagrammen
- Percelen combineren
II. Statistische analyse in R
1. Kansverdelingen
- R als een verzameling statistische tabellen
- Onderzoek naar de verdeling van een set gegevens
2. Testen van hypothesen
- Tests over een populatiegemiddelde
- Test van de waarschijnlijkheidsverhouding
- Tests met één en twee monsters
- Chi-kwadraat Goodness-of-fit-test
- Kolmogorov-Smirnov Statistiek met één steekproef
- Wilcoxon Signed-Rank Test
- Test met twee monsters
- Wilcoxon Rank Sum-test
- Mann-Whitney-test
- Kolmogorov-Smirnov-test
3. Meervoudig testen van hypothesen
- Type I-fout en FDR
- ROC-curves en AUC
- Meerdere testprocedures (BH, Bonferroni enz.)
4. Lineaire regressiemodellen
- Algemene functies voor het extraheren van modelinformatie
- Aangepaste modellen bijwerken
- Gegeneraliseerde lineaire modellen
- Gezinnen
- De glm() functie
- Classificatie
- Logistieke regressie
- Lineaire discriminant analyse
- Leren zonder toezicht
- Analyse van de belangrijkste componenten
- Clusteringmethoden (k-gemiddelden, hiërarchische clustering, k-medoids)
5. Overlevingsanalyse (overlevingspakket)
- Overlevingsobjecten in r
- Kaplan-Meier-schatting, log-rank-test, parametrische regressie
- Zelfvertrouwen bandjes
- Gecensureerde (interval gecensureerde) data-analyse
- Cox PH-modellen, constante covariabelen
- Cox PH-modellen, tijdsafhankelijke covariabelen
- Simulatie: Modelvergelijking (Regressiemodellen vergelijken)
6. Analyse van de variantie
- Enkele reis ANOVA
- Tweerichtingsclassificatie van ANOVA
- MANOVA
III. Uitgewerkte problemen in de bio-informatica
- Korte introductie tot het limma-pakket
- Workflow voor microarray-gegevensanalyse
- Gegevens downloaden van GEO: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE1397
- Gegevensverwerking (QC, normalisatie, differentiële expressie)
- Vulkaan plot
- Custering voorbeelden + heatmaps
28 Uren
Leveringsopties
PRIVÉGROEPSTRAINING
Onze identiteit draait om het leveren van precies wat onze klanten nodig hebben.
- Pre-cursusgesprek met uw trainer
- Aanpassing van de leerervaring om uw doelen te bereiken -
- Op maat gemaakte overzichten
- Praktische, praktische oefeningen met gegevens / scenario's die herkenbaar zijn voor de cursisten
- Training gepland op een datum naar keuze
- Gegeven online, op locatie/klaslokaal of hybride door experts die ervaring uit de echte wereld delen
Private Group Prices RRP from €9120 online delivery, based on a group of 2 delegates, €2880 per additional delegate (excludes any certification / exam costs). We recommend a maximum group size of 12 for most learning events.
Neem contact met ons op voor een exacte offerte en om onze laatste promoties te horen
OPENBARE TRAINING
Kijk op onze public courses
Reviews (5)
how the trainor shows his knowledge in the subject he's teachign
john ernesto ii fernandez - Philippine AXA Life Insurance Corporation
Cursus - Data Vault: Building a Scalable Data Warehouse
Very useful in because it helps me understand what we can do with the data in our context. It will also help me
Nicolas NEMORIN - Adecco Groupe France
Cursus - KNIME Analytics Platform for BI
I genuinely enjoyed the hands passed exercises.
Yunfa Zhu - Environmental and Climate Change Canada
Cursus - Foundation R
The pace was just right and the relaxed atmosphere made candidates feel at ease to ask questions.
Rhian Hughes - Public Health Wales NHS Trust
Cursus - Introduction to Data Visualization with Tidyverse and R
Richard's training style kept it interesting, the real world examples used helped to drive the concepts home.
